به موجب خبری که به صورت اختصاصی در اختیار عصر ایران قرار گرفته است آیت الله حاج شیخ عباس محفوظی از مراجع تقلید شیعه در قم ضمن تاکید بر مراتب فقهی و اجتهادی سید حسن خمینی از کاندیداتوری او برای مجلس خبرگان استقبال کرده است.
عین اظهارات ایشان از این قرار است:
«اینجانب عالم مجتهد سید حسن آقای خمینی را عالمی آگاه به زمان و متقی میدانم و معتقدم با وجود این که میسور و مقدور بود که ایشان صاحب مدارج علمی دانشگاهی در مباحث فلسفه و الهیات و غیره باشند و با وجود تحقیق و تتبع در فلسفه و الهیات اصل مبنای درس و بحث خود را در فقه صاحب جواهری قرار داد و بحمدالله پیشرفت چشمگیری در این علوم حاصل کرد.
هوش و استعداد و همت بلند او موجب شد که حوزه بحث این مجتهد جوان محل حضور مشتاقان فقه اهل البیت علیهم السلام باشد و البته از ذُرّیه پاکان و شرفا جز این انتظاری نیست.»
این مدرس حوزه به اظهار نظر درباره جنبه های فقهی و حوزوی نواده امام بسنده نکرده و درباره نگرش های سیاسی سید حسن خمینی نیز چنین گفته است:
«اینجانب با دقت در مواضع و نگرش های سیاسی ایشان تأمل داشتهام. حزم و احتیاط و رعایت تقوا در کلام و خردمندانه سخن گفتن طلیعه نیکویی را برای ایشان متصور میکند.»
آیتالله محفوظی در زمان حیات مرحوم آیت الله محمد تقی بهجت مرجع فقید تقلید از نزدیکترین کسان و مشاوران ایشان بودند و از سال 1389 اعلام مرجعیت کرده و در قم به تدریس و تحقیق و تربیت طلاب و فضلا مشغولاند.