در گذشته صدور پروانههای کاغذی موجب فساد شده بود و مثلا برخی با تأسیس دفاتری در بندرعباس پروانههای کاغذی گمرک را جعل میکردند. درحالی که با الکترونیکی شدن فرایند گمرکی دیگر امکان جعل اسناد وجود ندارد.
عملکرد سامانه جامع گمرکی نشان می دهد که امروز از جعل هزاران سند گمرکی جلوگیری شده است. تطبیق اسناد به صورت برخط با بانکها انجام و 35 نوع عوارض بهصورت الکترونیکی دریافت می شود.
با الکترونیکی شدن صدور پروانه دیگر نگرانی گم شدن و از بین رفتن اسناد کاغذی وجود ندارد و رسیدگی به پروندههای گمرکی در کوتاهترین زمان ممکن توسط کارشناسان امور گمرکی انجام میشود و صاحبان کالا میتوانند از آخرین وضعیت پروانههای گمرکی در کلیه رویههای گمرکی بدون مراجعه حضوری و بهصورت برخط مطلع شوند.