علی مطهری در پاسخ به یکی از دانشجویان در دانشگاه بینالمللی امام خمینی(ره) قزوین که درباره مسوولیت حصر میرحسین موسوی و مهدی کروبی پرسیده بود، گفت: مسوولیت حصر با قوه قضاییه است. حصر بدون حکم قضایی ظلم است. البته آقای روحانی به عنوان رییس شورای عالی امنیت ملی باید جسارت بیشتری داشته باشد و عقبنشینی درست نیست.